Врачи древности упоминали растение в своих научных трактатах. Так, Авиценна высоко ценил эстрагон за его лечебные свойства и упоминает о нём в "Каноне врачебной науки". Он рекомендовал его в качестве средства для улучшения аппетита и пищеварения, избавления от болей. В его трудах эстрагон упоминается как растение, которое помогает выводить токсины из организма и укрепляет иммунитет, улучшает состояние десен и зубов.

Когда эстрагон в XVII веке была завезен в Европу, французы первыми начали использовать эстрагон в кулинарии, он стал любимой французской пряной травой. Именно они изобрели рецепты с этим растением и добавляли во всевозможные блюда, включая и напитки. Со временем он шагнул в лоно высокого кулинарного искусства. Позднее, во Франции в XIX родился знаменитый соус "Бéарнез», аромат которого достигается за счёт эстрагона и других пряностей. Он подавался к мясу и рыбе и остаётся популярным по сей день.

В русские земли эстрагон попал, вероятно, через Кавказ и Центральную Азию. С XVIII века начали использовать как приправу, придающую особый вкус мясным и овощным блюдам. В народе его называли драгун-травой и страгоном. Он хорошо вписался в букет для засолки огурцов, его используют по сей день наряду с листьями смородины, хрена, вишни.