История старинного музея насчитывает более двух столетий. Основанный в 1811-м, он считается самым старым краеведческим музеем России. Обширные коллекции сосредоточены на истории юго-восточной части Крымского полуострова, где находится Феодосия. Экспонаты варьируются от артефактов первых обитателей Крыма до изделий середины XX в.

Со времен древних греков, основавших портовый город Феодосию, сохранилась старинная посуда. Находки от тех времен выставлены в залах археологии. Генуэзский период представлен нумизматическими коллекциями, оружием, предметами быта. С флорой и фауной Черного моря и Карадагского массива – главных природных достопримечательностей края – тоже можно познакомиться в музее.

Также есть коллекции, повествующие о Великой Отечественной войне, и лапидарий, включающий старинные могильные плиты, скульптуры, элементы декора зданий. Все были найдены в окрестностях города.