Святилище Иоанна Богослова возвышается над западными воротами Кремля. В состав архитектурного комплекса церковь введена в 1683 г. Здание перенесло два больших пожара. В итоге богослужения были прекращены, погреба отданы под склады.

К началу XIX века храм так сильно обветшал, что его чуть не разобрали для постройки другой церкви. Восстановление началось во второй половине XIX века, но окончательно вернули храм к жизни только в 1953 году, после очередного разрушения из-за сильного смерча.

Внутри церкви сохранились фрески XVII века, изображающие сцены из жизни Авраамия Ростовского и Иоанна Богослова.